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https://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5299| Tipo do documento: | Dissertação |
| Título: | Uma proposta para a predição computacional da estrutura terciária de polipeptídeos |
| Autor: | Cardoso, Marcos Borba  |
| Primeiro orientador: | Souza, Osmar Norberto de |
| Resumo: | Nos últimos anos, um dos grandes desafios da Ciência da Computação perante a Bioinformática é o desenvolvimento de algoritmos, os quais, em um tempo hábil, consigam gerar as estruturas terciárias de proteínas a partir da seqüência linear de seus aminoácidos. Embora existam alguns métodos que consigam gerar estruturas quando se possui outra proteína com um alto grau de similaridade, quando não se possui o mesmo, os métodos até então desenvolvidos não consigam realizar esta predição de forma não onerosa computacionalmente. Este trabalho apresenta um algoritmo recursivo capaz de predizer a topologia de polipeptídeos, utilizando apenas os ângulos da cadeia principal de proteínas com estruturas tridimensionais (3D) já conhecidas. O mesmo se mostra eficaz quando aplicado à mini-proteína Trp-Cage (código PDB 1L2Y) que possui apenas 20 aminoácidos, tendo uma estrutura predita de RMSD igual 3,7 Å; no entanto, para uma proteína de 34 aminoácidos Mini-Proteína Estabilizada por Pontes Dissulfeto (código PDB 1ZDD) o mesmo se mostra ineficiente, gerando a melhor proteína com o RMSD igual a 7,2 Å, devido ao fato de não ter sido percorrido todo o espaço conformacional esperado para a mesma. Os resultados e as suas conseqüências são discutidos no trabalho. |
| Palavras-chave: | INFORMÁTICA BIOLOGIA COMPUTACIONAL ESTRUTURA DE DADOS FUNÇÕES RECURSIVAS PROTEÍNAS |
| Área(s) do CNPq: | CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO |
| Idioma: | por |
| País: | BR |
| Instituição: | Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul |
| Sigla da instituição: | PUCRS |
| Departamento: | Faculdade de Informáca |
| Programa: | Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação |
| Citação: | CARDOSO, Marcos Borba. Uma proposta para a predição computacional da estrutura terciária de polipeptídeos. 2007. 64 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2007. |
| Tipo de acesso: | Acesso Aberto |
| URI: | http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5299 |
| Data de defesa: | 12-Jul-2007 |
| Aparece nas coleções: | Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação |
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| Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
|---|---|---|---|---|
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