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dc.creatorFreitas, Talita Freitas de-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/8550337247199157por
dc.contributor.advisor1Basso, Luiz Augusto-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3431777523511296por
dc.contributor.advisor-co1Timmers, Luis Fernando Saraiva Macedo-
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/6457381398342917por
dc.date.accessioned2022-09-16T14:58:33Z-
dc.date.issued2022-07-28-
dc.identifier.urihttps://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/10473-
dc.description.resumoEm 2017, a TB foi considerada uma das 10 principais causas de morte no mundo. A terapia medicamentosa utilizada atualmente no tratamento da TB possibilita ao paciente um rápido alívio dos sintomas, o que os estimula, em alguns casos, a interrupção prematura do tratamento. A TB resistente vem atingindo níveis cada vez mais alarmantes em todo o mundo, tornando-se indispensável que novas estratégias terapêuticas sejam desenvolvidas para contornar os mecanismos de resistência das micobactérias. Diante deste cenário torna-se necessário identificar e propor novos alvos moleculares que sejam, idealmente, essenciais, vulneráveis e seletivos. A via do ácido chiquímico recebeu notável atenção devido à identificação de uma das enzimas, 5-enolpiruvilchiquimato-3-fosfato (EPSP) sintase, como alvo molecular do herbicida glifosato (N-(fosfonometil)glicina). A ausência desta via metabólica em mamíferos e a sua essencialidade em plantas, fungos e bactérias, faz com que seja possível a obtenção de inibidores menos tóxicos ao hospedeiro. Esse projeto teve como objetivo principal identificar potenciais inibidores da biblioteca de compostos do Laboratório de Química do Centro de Pesquisas em Biologia Molecular e Funcional (CPBMF) utilizando a enzima chiquimato quinase (SK) de M. tuberculosis (MtSK), como alvo terapêutico para o desenvolvimento de novos fármacos contra a tuberculose. Duas estruturas tridimensionais da SK (PDB ID: 2IYS e 2IYQ), disponíveis no banco de dados de proteínas (PDB), foram utilizadas para a docagem molecular, a partir de um protocolo pré-estabelecido (redocking) pelo software AutoDock Vina. A predição de toxicidade e hepatotoxicidade dos compostos foram realizadas por meio do servidor web pkCSM, o qual filtrou 298 moléculas que não possuem caráter hepatotóxico e mutagênico. A partir dos escores da interação entre as pequenas moléculas e a enzima, e da inspeção visual das estruturas dos complexos, foram selecionados 30 compostos que mais interagiram com o sítio ativo da enzima. O ensaio de Máxima concentração permitida pela solubilidade permitiu selecionar 17 moléculas que foram analisadas em ensaios in vitro. Os compostos 1a, 1b, 3a, 3d e 5c tiveram potencial inibitório frente à enzima e à micobactéria, demonstrando assim compostos promissores a partir de uma biblioteca de moléculas não desenhada para a enzima MtSK.por
dc.description.abstractIn 2017, the Tuberculosis (TB) was considered one of the top 10 causes of death worldwide. The drug therapy currently used in the TB treatment allows the patient to quickly relieve symptoms, which encourages them, in some cases, to prematurely discontinue treatment. The TB resistant has reached increasingly alarming levels around the world, making it essential that new therapeutic strategies are developed to circumvent the resistance mechanisms of mycobacteria. Given this scenario, it is necessary to identify and propose new molecular targets that are, ideally, essential, vulnerable, and selective. The shikimic acid pathway has received notable attention due to the identification of one of the enzymes, 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate (ESPS) synthase, as a molecular target of the herbicide glyphosate (N-(phosphonomethyl)glycine). The absence in animals and essentiality in plants, fungi and bacteria suggest that structure-based chemotherapeutic development of anti-TB agents which are less toxic to the host is warranted using the shikimic acid pathway enzymes as targets. This project main goal is to identify potential inhibitors of compounds belonging to a library of Laboratório de Química do Centro de Pesquisas em Biologia Molecular e Funcional (CPBMF) using the shikimate kinase (SK) enzyme of M. tuberculosis (MtSK) as therapeutic target for the development of new drugs to treat TB. Two tridimensional structures of the SK (PDB ID: 2IYS e 2IYQ), available in the protein databank (PDB), were used in a molecular docking, based on a pre-established protocol (redocking) by the AutoDock Vina software. The prediction of toxicity and hepatotoxicity of the compounds were performed through the pkCSM web server, which filtered 298, which does not have hepatotoxic and mutagenic character. From the interaction between the structures of the components and the visual interaction of the characteristics of the components that most interacted with the enzyme site. The Maximum assay allowed by the solubility of the solution 17 were performed in in vitro assays. Those from compounds 1a, 1b, 3a, 3d and 5c had inhibitory potential to the enzyme and mycobacteria, thus demonstrating compounds a from a library front of promissory notes, not designed for an MtSK enzyme.eng
dc.description.provenanceSubmitted by PPG Medicina e Ciências da Saúde ([email protected]) on 2022-09-06T12:56:31Z No. of bitstreams: 1 TeseDeDoutorado-TalitaFreitasDeFreitas(09AGOSTO2022).pdf: 1852142 bytes, checksum: 6d319f8904ef45b48b6100ecc6a9ada7 (MD5)eng
dc.description.provenanceApproved for entry into archive by Caroline Xavier ([email protected]) on 2022-09-16T14:54:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseDeDoutorado-TalitaFreitasDeFreitas(09AGOSTO2022).pdf: 1852142 bytes, checksum: 6d319f8904ef45b48b6100ecc6a9ada7 (MD5)eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2022-09-16T14:58:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseDeDoutorado-TalitaFreitasDeFreitas(09AGOSTO2022).pdf: 1852142 bytes, checksum: 6d319f8904ef45b48b6100ecc6a9ada7 (MD5) Previous issue date: 2022-07-28eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.thumbnail.urlhttps://tede2.pucrs.br/tede2/retrieve/185478/TES_TALITA_FREITAS_DE_FREITAS_CONFIDENCIAL.pdf.jpg*
dc.languageporpor
dc.publisherPontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sulpor
dc.publisher.departmentEscola de Medicinapor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.initialsPUCRSpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Medicina e Ciências da Saúdepor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.subjectTuberculosepor
dc.subjectVia do Chiquimatopor
dc.subjectChiquimato Quinasepor
dc.subjectDocagem Molecularpor
dc.subjectAutoDock Vinapor
dc.subjectPyRxpor
dc.subjectpkCSMpor
dc.subjectConcentração Inibitória Mínimapor
dc.subjectTuberculosiseng
dc.subjectShikimate Pathwayeng
dc.subjectShikimate Kinaseeng
dc.subjectDocking Moleculareng
dc.subjectAutoDock Vinaeng
dc.subjectPyRxeng
dc.subjectpkCSMeng
dc.subjectMinimal Inhibitory Concentrationeng
dc.subject.cnpqCIENCIAS DA SAUDE::MEDICINApor
dc.titleEstudos funcionais de potenciais inibidores da enzima chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosispor
dc.typeTesepor
dc.restricao.situacaoTrabalho será publicado como artigo ou livropor
dc.restricao.prazo60 mesespor
dc.restricao.dataliberacao16/09/2027por
Appears in Collections:Programa de Pós-Graduação em Medicina e Ciências da Saúde

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