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Document type:	Dissertação
Title:	Uma proposta para a predição computacional da estrutura terciária de polipeptídeos
Author:	Cardoso, Marcos Borba
Advisor:	Souza, Osmar Norberto de
Abstract (native):	Nos últimos anos, um dos grandes desafios da Ciência da Computação perante a Bioinformática é o desenvolvimento de algoritmos, os quais, em um tempo hábil, consigam gerar as estruturas terciárias de proteínas a partir da seqüência linear de seus aminoácidos. Embora existam alguns métodos que consigam gerar estruturas quando se possui outra proteína com um alto grau de similaridade, quando não se possui o mesmo, os métodos até então desenvolvidos não consigam realizar esta predição de forma não onerosa computacionalmente. Este trabalho apresenta um algoritmo recursivo capaz de predizer a topologia de polipeptídeos, utilizando apenas os ângulos da cadeia principal de proteínas com estruturas tridimensionais (3D) já conhecidas. O mesmo se mostra eficaz quando aplicado à mini-proteína Trp-Cage (código PDB 1L2Y) que possui apenas 20 aminoácidos, tendo uma estrutura predita de RMSD igual 3,7 Å; no entanto, para uma proteína de 34 aminoácidos Mini-Proteína Estabilizada por Pontes Dissulfeto (código PDB 1ZDD) o mesmo se mostra ineficiente, gerando a melhor proteína com o RMSD igual a 7,2 Å, devido ao fato de não ter sido percorrido todo o espaço conformacional esperado para a mesma. Os resultados e as suas conseqüências são discutidos no trabalho.
Keywords:	INFORMÁTICA BIOLOGIA COMPUTACIONAL ESTRUTURA DE DADOS FUNÇÕES RECURSIVAS PROTEÍNAS
CNPQ Knowledge Areas:	CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Language:	por
Country:	BR
Publisher:	Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul
Institution Acronym:	PUCRS
Department:	Faculdade de Informáca
Program:	Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação
Citation:	CARDOSO, Marcos Borba. Uma proposta para a predição computacional da estrutura terciária de polipeptídeos. 2007. 64 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2007.
Access type:	Acesso Aberto
URI:	http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5299
Issue Date:	12-Jul-2007
Appears in Collections:	Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação

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