@MASTERSTHESIS{ 2016:1572601585,
 	title = {Determinação de energia livre de ligação por métodos in silico para ligantes da enzima InhA (EC 1.3.1.9) de Mycobacterium tuberculosis},
 	year = {2016},
 	url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/6877",
 	abstract = "A tuberculose é uma doença infectocontagiosa responsável por cerca de 1,3 milhão de mortes
 anualmente a nível mundial. Apesar do aparecimento de cepas multirresistentes de
 Mycobacterium tuberculosis (Mtb), desde a década de 80 se observa uma lacuna no
 desenvolvimento de novos antimicrobianos. Com o advento da bioinformática e biofísica
 molecular computacional, tornou-se possível, a partir de um alvo molecular preestabelecido,
 testar inúmeros candidatos a fármacos, com destaque para a predição da energia livre de
 ligação. Nesta dissertação, foram selecionados 14 compostos com conhecida atividade frente
 a enzima 2-trans-enoil-ACP redutase (InhA, EC 1.3.1.9) de Mtb. Estas moléculas foram
 divididas em 3 grupos. Grupo 1: 5 compostos com valores esparsos de energia livre. Grupo 2:
 9 compostos com valores similares de energia livre e derivadas do composto Genz-10850.
 Grupo 3: 14 compostos correspondendo à união dos Grupos 1 e 2. Amostragens por
 simulações de dinâmica molecular de 2 ns, em solvente explícito, permitiram estimar os
 valores da energia livre de ligação destes compostos com os métodos MM/GBSA,
 MM/PBSA, (QM)MM/GBSA, LigScore, DrugScore, AutoDock e SQM. O ranqueamento dos
 compostos foi baseado na correlação (R2) entre valores experimentais e estimados de energia
 livre. Os resultados apontaram valores de R2 similares entre os métodos testados. Técnicas
 mais robustas, como SQM e (QM)MM/GBSA, não obtiveram resultados mais acurados em
 comparação àquelas mais simples, como LigScore e DrugScore. No geral, foram obtidos
 valores moderados de correlação (R2 de 0,00-0,80) para o Grupo 1. Os Grupos 2 e 3 exibiram
 correlações fracas (R2 <0,40). Apesar dos resultados satisfatórios para o Grupo 1, os métodos
 utilizados apresentaram limitações e não foram capazes de predizer e ranquear corretamente
 compostos com valores próximos de energia livre e estruturas moleculares similares, como os
 do Grupo 2.",
 	publisher = {Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Farmacêutica},
 	note = {Faculdade de Farmácia}
}