@PHDTHESIS{ 2022:1323379307, title = {Prospecção de enoil-redutases alternativas em Mycobacterium tuberculosis}, year = {2022}, url = "https://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/10338", abstract = "Os últimos dados divulgados em 2021 pela Organização Mundial da Saúde em relação à tuberculose são ainda mais alarmantes que os anteriores, revelando uma notável diminuição nos números de notificações de casos e tratamento da doença, aliados ao aumento do número de indivíduos mortos pela doença, relacionados principalmente com o advento e esforços para conter a COVID-19. Apesar de ter tratamento efetivo, a tuberculose continua sendo uma grande preocupação, uma vez que há diversas cepas resistentes aos fármacos utilizados para o tratamento e indivíduos com a forma latente atuam como reservatórios da doença. Os mecanismos de resistência são amplamente estudados como estratégia de desenvolvimento de novos fármacos. O composto triclosan tem seu mecanismo de resistência elucidado e a relação com diferentes subtipos de proteínas enoil-redutases relatado. Com o propósito de aumentar o entendimento acerca da biologia do patógeno, buscamos prospectar possíveis enoil-redutases alternativas à InhA em Mycobacterium tuberculosis. No capítulo 1 dessa tese é apresentada, na forma de um manuscrito publicado na revista Frontiers in Microbiology, uma revisão de literatura acerca dos diversos subtipos de enoil-redutases encontradas, dos organismos que as possuem e de sua atuação na síntese de ácidos graxos. No capítulo seguinte, estruturado na forma de um segundo manuscrito, são relatadas análises referentes às proteínas codificadas por três genes de M. tuberculosis (Rv3553, Rv0021c e Rv1533), que se mostraram altamente similares estruturalmente à proteína FabK de Streptococcus pneumoniae (SpFabK), pertencente a uma família de enoil-redutases alternativa à família a qual pertence à proteína InhA de M. tuberculosis. Para cada um dos genes, são descritas as modificações estruturais presentes nas regiões correspondentes ao sítio ativo da SpFabK. Além disso, são apresentados, para cada um dos três genes, dados de vulnerabilidade utilizando a técnica de silenciamento gênico CRISPR de interferência, a habilidade de infecção de células de macrófagos murinos, e a concentração inibitória mínima de cepas merodiploides para triclosan e isoniazida. Apenas o silenciamento do gene Rv1533 perturbou o crescimento do bacilo nas condições testadas. Ainda no capítulo 2, são apresentadas as redes de coexpressão para os genes Rv3553 e Rv1484 e, com base em dados de RNA-Seq disponíveis publicamente, a análise de expressão diferencial dos três genes em condições de cultivo diferentes daquelas estudadas experimentalmente. Os resultados obtidos revelam que os genes Rv3553, Rv0021c e Rv1533 apresentam padrões de expressão distintos aos encontrados para o gene inhA. Ao final do capítulo 2, com base nos padrões de expressão diferencial observados, são tecidas considerações acerca do potencial do gene Rv1533 atuar como uma enoil-redutase alternativa em condições de depleção nutricional. Por fim, no capítulo 3, são acrescentados os resultados parciais encontrados: dados de essencialidade gênica para o gene Rv1533, análise de concentração inibitória mínima frente ao triclosan e à isoniazida e as quantificações de RNA mensageiro nas cepas com os genes silenciados. Finalmente, são descritas as considerações finais e perspectivas para o presente estudo.", publisher = {Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul}, scholl = {Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular}, note = {Escola de Ciências Saúde e da Vida} }