@PHDTHESIS{ 2019:207308394,
 	title = {Filogen?mica de Otariidae e hist?ria evolutiva de lobos-marinhos da Am?rica do Sul},
 	year = {2019},
 	url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/8903",
 	abstract = "A sistem?tica, a filogenia e a hist?ria evolutiva de Otariidae (lobos e le?es-marinhos) s?o debatidas desde as descri??es das primeiras esp?cies por exploradores naturalistas europeus. Atualmente, diversas rela??es, em particular dentro de Arctocephalus, permanecem confusas. Estudos moleculares recentes envolvendo esp?cies da fam?lia basearam-se somente em poucos fragmentos de DNA, em sua maioria, regi?es mitocondriais concatenadas, com o objetivo de decifrar a biogeografia dos lobos e le?es-marinhos. Assim como para a Otariidae, as rela??es entre Arctocephalus australis (lobo-marinho-peruano-chileno e lobo-marinho-sul-americano), A. galapagoensis (lobo-marinho-de-Gal?pagos) e A. forsteri (lobo-marinho-da-Nova Zel?ndia) tamb?m s?o bastante discutidas. Embora atualmente reconhecidas como esp?cies plenas, todos os estudos com um enfoque populacional, aplicando mais de um indiv?duo por t?xon, demonstraram a parafilia deste grupo. Em dois manuscritos aplicamos uma abordagem gen?mica para esclarecer as rela??es filogen?ticas de Otariidae e o processo evolutivo de A. australis (e suas duas subunidades populacionais), A. galapagoensis e A. forsteri. Para isso, avaliamos 15 genomas completos, sendo 12 sequenciados pelo nosso grupo de pesquisa e tr?s obtidos do GenBank. Al?m disso, tamb?m sequenciamos uma biblioteca de representa??o reduzida (m?todo ddRAD-seq) composta por indiv?duos de A. australis (n=15/13, subpopula??es do sul do Chile/Oceano Atl?ntico e Peru/Norte do Chile, respectivamente), A. galapagoensis (n=10) e A. forsteri (n=9). Em nosso trabalho, encontramos um elevado grau de discord?ncia geneal?gica ao longo dos genomas, o qual atribu?mos, principalmente, ? separa??o incompleta de linhagens g?nicas. Identificamos que o elevado n?mero de topologias ?nicas se deu ? um explosivo per?odo de especia??o conduzido pelo resfriamento das ?guas superficiais do Oceano Pac?fico, na transi??o Plio-Pleistoceno h? ~3 Ma. Al?m disso, m?todos variados de reconstru??es filogen?ticas recuperaram, de forma consistente, a monofilia do g?nero Arctocephalus, sugerindo a manuten??o da atual nomenclatura taxon?mica. An?lises com genomas completos e bibliotecas de representa??o reduzida tamb?m mostraram a clara delimita??o entre A. australis, A. galapagoensis e A. forsteri. Encontramos, tamb?m, evid?ncias de que a subpopula??o peruana/chilena de A. australis compartilha componentes gen?micos entre A. galapagoensis e a subpopula??o do sul do Chile/Oceano Atl?ntico de A. australis. An?lises posteriores suportaram que esta mistura reflete uma antiga origem h?brida da subunidade populacional do lobo-marinho-peruano/chileno. Tamb?m detectamos a presen?a de indiv?duos puros de A. galapagoensis (primeiramente identificados como A. australis) em Isla Foca, uma col?nia reprodutiva isolada e localizada h? ~1000 km ao norte da distribui??o principal de A. australis (subunidade peruano/chilena) e ? leste da distribui??o de A. galapagoensis. Dois retrocruzamentos entre o t?xon h?brido e A. galapagoensis tamb?m foram detectados em Isla Foca e em Punta San Juan, Peru, a maior col?nia reprodutiva dos lobos-marinhos-peruanos-chilenos. Esses achados demonstram a necessidade de futuros estudos em Isla Foca para compreender o seu papel nas din?micas populacionais, na distribui??o e na conserva??o dos t?xons mencionados. Nos artigos apresentados delimitamos esp?cies, esclarecemos a complexa hist?ria evolutiva de lobos e le?es-marinhos e resolvemos questionamentos fundamentais sobre as rela??es internas de Otariidae. Tamb?m demonstramos a import?ncia de considerar as discord?ncias geneal?gicas na interpreta??o da hist?ria evolutiva e de considerar o fluxo g?nico interespec?fico como for?a evolutiva na gera??o de biodiversidade.",
 	publisher = {Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de P?s Gradua??o em Ecologia e Evolu??o da Biodiversidade},
 	note = {Escola de Ci?ncias}
}