@MASTERSTHESIS{ 2017:930507626,
 	title = {Phylogenetic analyses of DNA sequences reveal a vastly underestimated radiation of Amazonian Salamanders (Plethodontidae: bolitoglossa), with key implications to the study of plethodontid diversification},
 	year = {2017},
 	url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/8823",
 	abstract = "O reconhecimento da biodiversidade ? um dos desafios mais gratificantes na biologia, porque quando mais conhecemos sob as coisas que nos rodeiam mais entendemos os processos e mudam nossa percep??o de ver as coisas. As salamandras da fam?lia Plethodontidae sofreram processos complexos de especia??o onde principalmente tem diversificado em Am?rica do Norte e Mesoamerica, resultando no 66 % da diversidade de Caudata. Por outro lado, as salamandras da Am?rica do Sul albergam uma pequena diversidade (37 esp?cies) onde a maioria pertence ao g?nero Bolitoglossa, este padr?o ? o resultado de uma coloniza??o tardia onde as esp?cies n?o tiverem o suficiente tempo para especiar. N?o obstante, trabalhos recentes sugerem que a diversidade de salamandras na Am?rica do Sul est? sendo subestimada, refletindo nosso conhecimento e ignor?ncia deste grupo. Neste contexto, n?s estudamos as salamandras amaz?nicas fornecendo uma explica??o filogen?tica da varia??o molecular de diferentes amostras de Bolitoglossa no contexto da radia??o do g?nero, e avaliar as implica??es destes resultados no entendimento da diversidade de esp?cies de Bolitoglossa na Amaz?nia, como tamb?m sua diversifica??o e biogeografia. Foram obtidos dados de oito das nove esp?cies distribu?das na Amaz?nia seja perto e/ou da localidade tipo, al?m disso, foram geradas novas sequencias para 177 terminais da maioria das popula??es amaz?nicas desde Venezuela at? Bol?via, e as analisamos junto com as sequencias dispon?veis em bases de dados p?blicas. Nosso estudo representa a amostragem mais completa de taxa do g?nero (~ 75 % da diversidade atual) para avaliar as rela??es de Bolitoglossa. Os dados foram analisados usando m?xima verossimilhan?a com um alinhamento por similaridade e incluindo os indels como car?ter bin?rio e com parcim?nia com homologia din?mica e indels como quinto estado de car?ter. Apesar de ambas as an?lises mostrarem diferen?as nas topologias ?timas, os resultados s?o
 V
 incompat?veis com a presen?a de s? 9 esp?cies de Bolitoglossa na bacia amaz?nica (a diversidade atualmente reconhecida). Usando m?todos objetivos de delimita??o de esp?cies, calculamos um aumento da riqueza de esp?cies de 300?400 %. A reconstru??o de ?reas ancestrais em ambas as topologias indica que uma ?nica coloniza??o da Amaz?nia desde os Andes ? respons?vel da grande radia??o de salamandras em Am?rica do Sul. Nossos resultados mudam o paradigma atual sobre a diversifica??o das salamandras neotropicais.",
 	publisher = {Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de P?s Gradua??o em Ecologia e Evolu??o da Biodiversidade},
 	note = {Escola de Ci?ncias}
}