@MASTERSTHESIS{ 2015:1615142773, title = {wCReF : uma interface web para o m?todo CReF de predi??o da estrutura 3D aproximada de prote?nas}, year = {2015}, url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7698", abstract = "A predi??o da estrutura terci?ria de prote?nas ? um problema da Bioinform?tica Estrutural ainda n?o solucionado pela ci?ncia. O desafio ? entender a rela??o entre a sequ?ncia de amino?cidos de uma prote?na e sua estrutura tridimensional 3D, que est? relacionada ? fun??o destas macromol?culas. Dentre os m?todos relacionados ? predi??o de estruturas de prote?nas est? o M?todo CReF (Central Residue Fragment-based Method), proposto por Dorn & Norberto de Souza (2008), para predi??o da estrutura 3D aproximada de uma prote?na ou polipept?dio. Nesta disserta??o, apresentamos o wCReF, a interface Web para o m?todo CReF desenvolvida com o enfoque em usabilidade. Com esta ferramenta o usu?rio informa a sequ?ncia de amino?cidos de sua prote?na alvo, e como resultado obt?m a estrutura 3D aproximada de uma prote?na, de forma automatizada, sem a necessidade de instala??o das ferramentas necess?rias para sua utiliza??o. Para definir os requisitos necess?rios para seu desenvolvimento foram realizadas avalia??es de usabilidade, realizadas por especialistas em Intera??o Humano-Computador e da ?rea de dom?nio, a bioinform?tica, em tr?s servidores de predi??o de estruturas de prote?nas - I-TASSER, QUARK e Robetta - todos participantes do CASP (Critical Assessment of protein Structure Prediction). As inspe??es foram realizadas atrav?s do m?todo de Avalia??o Heur?stica, utilizando as 10 heur?sticas de Nielsen. Como resultado, foram encontradas viola??es em todas as heur?sticas e detectados 89 problemas de usabilidade. Eles foram classificados em 5 severidades, 29 pontuados como sendo de alta prioridade de solu??o e 25 problemas de resolu??o imediata. Os resultados das avalia??es serviram como orienta??o norteadora dos principais recursos que o wCReF deveria possuir, compilados em um documento de requisitos de software, para sua implementa??o. A partir desta etapa foi realizada a prototipagem, vislumbrando a detec??o de novos problemas de usabilidade, com os usu?rios finais, atrav?s da adapta??o do question?rio de satisfa??o de Ssemugabi. Como produto final, apresentamos o servidor wCReF alicer?ado na preocupa??o com a usabilidade e intera??o com seus usu?rios. Al?m disso, este estudo pode contribuir para melhoria da usabilidade das aplica??es de bioinform?tica j? existentes, dos servidores de predi??o analisados e no desenvolvimento de novas ferramentas cient?ficas.", publisher = {Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul}, scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia da Computa??o}, note = {Faculdade de Inform?tica} }