@MASTERSTHESIS{ 2017:1566474113,
 	title = {Biologia de sistemas computacional aplicada ? via metab?lica do chiquimato : enfoque na enzima 3-desidroquinato desidratase (EC 4.2.1.10)},
 	year = {2017},
 	url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7395",
 	abstract = "Microrganismos, em geral, apresentam-se como os principais agentes de doen?as em seres humanos. Dados do Minist?rio da Sa?de Brasileiro demonstram doen?as bacterianas como as principais causas de morte no pa?s. Na terap?utica desses organismos, os antibi?ticos s?o considerados os m?todos quimioter?picos de maior sucesso da medicina do s?culo XXI, pois representam a primeira, e ?nica, linha de combate contra doen?as bacterianas. O desenvolvimento de novas drogas antibi?ticas torna-se cada vez mais necess?rio, uma vez que os ?ndices de resist?ncia bacteriana se tornam mais altos a cada ano. Nesse ponto, a rota metab?lica do chiquimato ? atraente a esse tipo de pesquisa, por ser considerada uma via essencial para a manuten??o desses organismos no ambiente, al?m de estar ausente em animais. A via ? respons?vel pela forma??o do corismato, precursor de amino?cidos arom?ticos (Phe, Trp e Tyr), ?cido f?lico e ubiquinonas nos grupos de seres vivos onde est? presente. A terceira rea??o da via biossint?tica do chiquimato ? realizada pela enzima DHQD. Nesse passo ? realizada a desidrata??o revers?vel da mol?cula DHQ visando transform?-la em 3-desidrochiquimato, rea??o foco desse estudo. Na busca por novos inibidores de DHQD foram realizadas simula??es de docking de pequenos ligantes contra a estrutura tridimensional de uma prote?na alvo, pois ? um processo onde se visa encontrar, entre as poss?veis orienta??es/conforma??es de um ligante no s?tio ativo, aquela que apresenta a menor energia de liga??o e, consequente, maior finidade. Al?m das simula??es de docking, foram realizados m?todos de Aprendizagem de M?quina na formula??o de fun??es escores polinomiais, a partir de fun??es escores presentes no MVD, que fossem capazes de prever a afinidade entre prote?na/ligante. Ao final de todas as simula??es e testes realizados ao longo do projeto, chegamos ? conclus?o de que a equa??o Polscore56 apresentou-se como a mais h?bil para prever a afinidade entre o s?tio ativo de DHQD com compostos testados. Para esse polin?mio os resultados de test set (? = 0,900; p-value = 0,037), AUC (74,686%), EF1 (540) e EF2 (159,23) foram, na maioria das categorias avaliadas, os melhores, confirmando as hip?teses formuladas sobre a equa??o e indicando-a para estudos posteriores com a enzima.",
 	publisher = {Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Biologia Celular e Molecular},
 	note = {Faculdade de Bioci?ncias}
}