@MASTERSTHESIS{ 2016:1537377497,
 	title = {Determina??o de energia livre de liga??o por m?todos in silico para ligantes da enzima InhA (EC 1.3.1.9) de Mycobacterium tuberculosis},
 	year = {2016},
 	url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/6877",
 	abstract = "A tuberculose ? uma doen?a infectocontagiosa respons?vel por cerca de 1,3 milh?o de mortes
 anualmente a n?vel mundial. Apesar do aparecimento de cepas multirresistentes de
 Mycobacterium tuberculosis (Mtb), desde a d?cada de 80 se observa uma lacuna no
 desenvolvimento de novos antimicrobianos. Com o advento da bioinform?tica e biof?sica
 molecular computacional, tornou-se poss?vel, a partir de um alvo molecular preestabelecido,
 testar in?meros candidatos a f?rmacos, com destaque para a predi??o da energia livre de
 liga??o. Nesta disserta??o, foram selecionados 14 compostos com conhecida atividade frente
 a enzima 2-trans-enoil-ACP redutase (InhA, EC 1.3.1.9) de Mtb. Estas mol?culas foram
 divididas em 3 grupos. Grupo 1: 5 compostos com valores esparsos de energia livre. Grupo 2:
 9 compostos com valores similares de energia livre e derivadas do composto Genz-10850.
 Grupo 3: 14 compostos correspondendo ? uni?o dos Grupos 1 e 2. Amostragens por
 simula??es de din?mica molecular de 2 ns, em solvente expl?cito, permitiram estimar os
 valores da energia livre de liga??o destes compostos com os m?todos MM/GBSA,
 MM/PBSA, (QM)MM/GBSA, LigScore, DrugScore, AutoDock e SQM. O ranqueamento dos
 compostos foi baseado na correla??o (R2) entre valores experimentais e estimados de energia
 livre. Os resultados apontaram valores de R2 similares entre os m?todos testados. T?cnicas
 mais robustas, como SQM e (QM)MM/GBSA, n?o obtiveram resultados mais acurados em
 compara??o ?quelas mais simples, como LigScore e DrugScore. No geral, foram obtidos
 valores moderados de correla??o (R2 de 0,00-0,80) para o Grupo 1. Os Grupos 2 e 3 exibiram
 correla??es fracas (R2 <0,40). Apesar dos resultados satisfat?rios para o Grupo 1, os m?todos
 utilizados apresentaram limita??es e n?o foram capazes de predizer e ranquear corretamente
 compostos com valores pr?ximos de energia livre e estruturas moleculares similares, como os
 do Grupo 2.",
 	publisher = {Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Biotecnologia Farmac?utica},
 	note = {Faculdade de Farm?cia}
}