@MASTERSTHESIS{ 2015:1846841738, title = {Hist?ria evolutiva e din?mica demogr?fica de Cavia intermedia (Mammalia: Rodentia) inferida atrav?s de abordagem gen?mica}, year = {2015}, url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/6216", abstract = "Popula??es insulares sempre tem sido objeto de interesse para estudos gen?ticos e ecol?gicos. A esp?cie insular Cavia intermedia ? um dos mam?feros mais raros no mundo, com um tamanho de censo populacional de aproximadamente 40 indiv?duos, corroborado por uma diversidade gen?tica e tamanho populacional efetivo (Ne) extremamente baixos. Aqui, n?s usamos sequenciamento de DNA associado a s?tios de restri??o (no ingl?s, RAD-seq) para obter dados de sequencias ao longo do genoma de C. intermedia e sua esp?cie-irm? continental, C. magna, para estudar sua diversidade molecular e hist?ria demogr?fica. N?s geramos um total de 10 milh?es de reads de 300 bp para 20 indiv?duos de cada esp?cie. Entretanto, mesmo usando o genoma de Cavia porcellus como refer?ncia ou abordagem de novo e aplicando filtros rigoroso para qualidade e dados faltantes, apenas uma centena de loci puderam ser usados. Este conjunto final de dados gerou valores de diversidade molecular e tempo de diverg?ncia amplamente diferentes entre os m?todos de an?lise, alguns compat?veis com estudos anteriores (e.g., Ne ~60 para C. intermedia) mas alguns com valores significativamente maiores. N?s sugerimos que para obter um conjunto de dados de alta qualidade e muito informativo seria necess?rio aumentar significativamente os dados de sequ?ncia bem como aplicar outras abordagens de montagem.", publisher = {Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul}, scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Zoologia}, note = {Faculdade de Bioci?ncias} }