@MASTERSTHESIS{ 2013:1012457036,
 	title = {Simula??o computacional do sistema prote?na-ligante : estudo da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis},
 	year = {2013},
 	url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/1719",
 	abstract = "A Tuberculose continua sendo a causa mais comum de morte em decorr?ncia de um agente infeccioso. Entre os alvos identificados no genoma do Mycobaterium tuberculosis, enzimas da via do chiquimato merecem aten??o especial. A chiquimato quinase ? a quinta enzima da via do chiquimato, e tem sido identificada em fungos, organismos do filo apicomplexa, plantas e procariontes. Esta via metab?lica ? composta por sete passos, que catalisam sequencialmente a convers?o de eritrose-4-fosfato e fosfoenolpiruvato em corismato; e ? respons?vel pela bioss?ntese de amino?cidos arom?ticos. Chiquimato quinase parece ser essencial para a sobreviv?ncia do Mycobacterium tuberculosis, uma vez que ? ausente no homem, esta enzima ? considerada como um alvo para o desenvolvimento de quimioter?picos e medicamentos contra a tuberculose. O objetivo ? identificar poss?veis inibidores, focando as simula??es de docking molecular no s?tio de liga??o do ATP da enzima. O programa usado nas simula??es foi o Molegro Virtual Docker e a intera??o prote?na-ligante foi testada em 12 estruturas cristalogr?ficas e logo ap?s, escolhido um protocolo de docking a partir de valores de RMSD abaixo de 2?. O m?todo foi validado usando o melhor protocolo de re-docking no Virtual Screening atrav?s do Fator de Enriquecimento que obteve resultado de 24,57%, que ? considerado adequado para as simula??es de docking molecular focados em quinases. O presente protocolo de docking foi aplicado em um banco de dados com mais de 80.000 mol?culas. A an?lise dos resultados identificaram 5 potenciais inibidores da chiquimato quinase. Na an?lise das intera??es intermoleculares entre a enzima e os ligantes foram identificadas caracter?sticas estruturais respons?veis pela afinidade da liga??o pelo ligante. Este ? o primeiro estudo de docking molecular focado no bols?o de liga??o do ATP da chiquimato quinase.",
 	publisher = {Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Medicina e Ci?ncias da Sa?de},
 	note = {Faculdade de Medicina}
}