@MASTERSTHESIS{ 2024:347132830,
 	title = {Desenvolvimento de marcadores genômicos para análises genéticas, ecológicas e forenses de onças-pintadas (Panthera onca)},
 	year = {2024},
 	url = "https://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/11273",
 	abstract = "O manejo da vida selvagem exige ferramentas poderosas para monitorar e proteger a biodiversidade à medida que esta diminui rapidamente. Nesse sentido, a área da genômica trouxe novas possibilidades para o desenvolvimento de ferramentas simples e econômicas baseadas em polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), que melhoram as estimativas genéticas em relação a marcadores tradicionais, como os microssatélites. A aplicação de painéis de SNPs selecionados e otimizados a partir de grandes conjuntos de dados genômicos tem um grande potencial no contexto dos esforços de conservação de espécies esquivas e ameaçadas, como a onça-pintada (Panthera onca), o maior felídeo das Américas e espécie guarda-chuva para conservação da biodiversidade. Neste estudo, a partir de um conjunto de dados de 58 genomas completos de onças-pintadas do Brasil, identificamos e selecionamos SNPs altamente informativos para rastreabilidade geográfica, identificação individual, parentesco e sexagem. Através de uma rigorosa filtragem, foram escolhidos 459 SNPs dentre 13.373.949 marcadores, com base no FST inter-bioma, para compor um painel junto de outros 8 SNPs ligados ao sexo. Deste painel, selecionamos subconjuntos de forma aleatória e identificamos um com apenas 84 SNPs que apresentou um poder de resolução semelhante ao painel completo. Quanto à atribuição de origem geográfica, tanto o painel geral quanto o subconjunto atingiram uma acurácia de 98% relativa ao bioma de origem das amostras e 65-69% delas foram atribuídas a um raio de até 500 km da sua origem. Para identificação individual, observamos que 10-18 SNPs dentre os marcadores selecionados são suficientes para diferenciar indivíduos, enquanto 6 SNPs ligados ao sexo são capazes de separar corretamente machos e fêmeas. Por fim, através de uma validação in silico, também foi possível recuperar corretamente as relações de parentesco entre os indivíduos testados, ressaltando a versatilidade desses marcadores e seu potencial para o desenvolvimento de ensaios de genotipagem como ferramenta para perguntas forenses, genéticas e ecológicas envolvendo onças-pintadas.",
 	publisher = {Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de Pós Graduação em Ecologia e Evolução da Biodiversidade},
 	note = {Escola de Ciências Saúde e da Vida}
}