@MASTERSTHESIS{ 2021:385112619,
 	title = {Estudo in silico, por din?mica molecular cl?ssica, da estrutura terci?ria da enzima MtInhA (EC 1.3.1.9) de Mycobacterium tuberculosis sob restri??es da estrutura quatern?ria},
 	year = {2021},
 	url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/9748",
 	abstract = "Flexibilidade e fun??o s?o propriedades relacionadas no estudo da din?mica proteica. A flexibilidade reflete no potencial conformacional das prote?nas e, deste modo, nas suas funcionalidades. A presen?a de intera??es entre complexos prote?na-ligante e prote?na-prote?na, de substratos e altera??es ambientais, podem alterar a plasticidade proteica, atuando desde o rearranjo das cadeias laterais de amino?cidos at? o desdobramento/dobramento de grandes motivos estruturais. Com o intuito de avaliar os efeitos da flexibilidade em sistemas proteicos, definimos como alvo do nosso trabalho a enzima 2-trans-enoil-ACP (CoA) redutase de Mycobacterium tuberculosis (Mtb), ou MtInhA, a qual apresenta-se como um homotetr?mero em solu??o. Apesar de a sua estrutura quatern?ria ser a forma biologicamente ativa, estudos computacionais simulam a MtInhA como um mon?mero, justificando a independ?ncia dos s?tios ativos devido ?s suas dist?ncias, assim como, o custo computacional. Entretanto, j? foram descritas diferen?as na flexibilidade entre as formas tetram?rica e monom?rica, as quais impactam no tamanho da cavidade de liga??o da enzima. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi construir um modelo de simula??o monom?rico da MtInhA que apresente as caracter?sticas conformacionais da estrutura quatern?ria da enzima. Para espelhar a influ?ncia das subunidades e obter comportamento similar ? prote?na na forma nativa, aplicamos diferentes constantes de for?a na estrutura monom?rica, para restringir movimento dos res?duos que comp?em a cavidade de liga??o do substrato. A partir da compara??o entre os sitemas monom?rico com restri??es, tetram?rico e monom?rico sem restri??es, observamos que as simula??es com constantes de for?a aplicadas apresentam um comportamento similar ? prote?na nativa. N?o obstante, essas semelhan?as s?o mais proeminentes nas al?as A e B, as quais s?o regi?es importantes para a modula??o da flexibilidade do s?tio ativo. Portanto, a partir destes resultados apresentamos um modelo de simula??o monom?rico da MtInhA, que possui caracter?sticas conformacionais da estrutura biologicamente ativa. Assim, os dados obtidos neste trabalho poder?o ser aplicados para a gera??o de modelos flex?veis mais confi?veis para docagem molecular, e tamb?m para a realiza??o de simula??es por din?mica molecular mais longas e com um menor custo computacional.",
 	publisher = {Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Biologia Celular e Molecular},
 	note = {Escola de Ci?ncias}
}