@MASTERSTHESIS{ 2015:1099213135,
 	title = {wCReF : uma interface web para o método CReF de predição da estrutura 3D aproximada de proteínas},
 	year = {2015},
 	url = "http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7698",
 	abstract = "A predição da estrutura terciária de proteínas é um problema da Bioinformática Estrutural ainda
 não solucionado pela ciência. O desafio é entender a relação entre a sequência de aminoácidos
 de uma proteína e sua estrutura tridimensional 3D, que está relacionada à função destas
 macromoléculas. Dentre os métodos relacionados à predição de estruturas de proteínas está o
 Método CReF (Central Residue Fragment-based Method), proposto por Dorn & Norberto de
 Souza (2008), para predição da estrutura 3D aproximada de uma proteína ou polipeptídio. Nesta
 dissertação, apresentamos o wCReF, a interface Web para o método CReF desenvolvida com
 o enfoque em usabilidade. Com esta ferramenta o usuário informa a sequência de aminoácidos
 de sua proteína alvo, e como resultado obtém a estrutura 3D aproximada de uma proteína, de
 forma automatizada, sem a necessidade de instalação das ferramentas necessárias para sua
 utilização. Para definir os requisitos necessários para seu desenvolvimento foram realizadas
 avaliações de usabilidade, realizadas por especialistas em Interação Humano-Computador e da
 área de domínio, a bioinformática, em três servidores de predição de estruturas de proteínas -
 I-TASSER, QUARK e Robetta - todos participantes do CASP (Critical Assessment of protein
 Structure Prediction). As inspeções foram realizadas através do método de Avaliação
 Heurística, utilizando as 10 heurísticas de Nielsen. Como resultado, foram encontradas
 violações em todas as heurísticas e detectados 89 problemas de usabilidade. Eles foram
 classificados em 5 severidades, 29 pontuados como sendo de alta prioridade de solução e 25
 problemas de resolução imediata. Os resultados das avaliações serviram como orientação
 norteadora dos principais recursos que o wCReF deveria possuir, compilados em um
 documento de requisitos de software, para sua implementação. A partir desta etapa foi realizada
 a prototipagem, vislumbrando a detecção de novos problemas de usabilidade, com os usuários
 finais, através da adaptação do questionário de satisfação de Ssemugabi. Como produto final,
 apresentamos o servidor wCReF alicerçado na preocupação com a usabilidade e interação com
 seus usuários. Além disso, este estudo pode contribuir para melhoria da usabilidade das
 aplicações de bioinformática já existentes, dos servidores de predição analisados e no
 desenvolvimento de novas ferramentas científicas.",
 	publisher = {Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação},
 	note = {Faculdade de Informática}
}